the 12 moons of ikutaro, das ursprünglich 1993 erscheinen sollte, erzählt die geschichte von shioi, einem jungen mädchen, das sich auf eine intergalaktische reise begibt, um den tod ihres vaters zu rächen. ihre reise führt sie in das sonnensystem von ikutaro, wo sie jeden mond besuchen muss, um den moon boss zu besiegen und schließlich den system controller zu zerstören. mit hilfe ihres „liquid sound device“ reist sie auf ihrem „modell jp8080“ zwischen den monden hin und her und trifft unterwegs auf verschiedene freunde und feinde.